Les Querini furent chassés de Venise, aprés l'échec d'un complot. Ils se réfugièrent dans l'île de Stampalia, possession grecque.
Cette branche de la famille s'appela alors les Querini-Stampalia.
En 1868, ils légèrent à l'état leur palais, le mobilier, livres et oeuvres d'art en sa possession.
Le palais est devenu un musée, renfermant plusieurs centaines d'oeuvres de l'école vénitienne, dont Gabriel Bella ou Pietro Longhi.